MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017857	T	6	6	208535	208540	0 %	100 %	0 %	0 %	387126099
4002	NC_017857	ACC	2	6	208580	208585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126099
4003	NC_017857	TTGC	2	8	208630	208637	0 %	50 %	25 %	25 %	387126099
4004	NC_017857	CTG	2	6	208656	208661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126099
4005	NC_017857	TTG	2	6	208667	208672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126099
4006	NC_017857	AAC	2	6	208678	208683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126099
4007	NC_017857	GCC	2	6	208726	208731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126099
4008	NC_017857	CCA	2	6	208773	208778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126099
4009	NC_017857	TCA	2	6	208850	208855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126099
4010	NC_017857	TTG	2	6	208885	208890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126099
4011	NC_017857	GCGGTC	2	12	209056	209067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387126099
4012	NC_017857	TTCC	2	8	209097	209104	0 %	50 %	0 %	50 %	387126099
4013	NC_017857	ATT	2	6	209134	209139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126099
4014	NC_017857	ATC	2	6	209215	209220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126099
4015	NC_017857	AGTC	2	8	209229	209236	25 %	25 %	25 %	25 %	387126099
4016	NC_017857	GCC	2	6	209281	209286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126099
4017	NC_017857	GTT	2	6	209382	209387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126099
4018	NC_017857	C	6	6	209408	209413	0 %	0 %	0 %	100 %	387126099
4019	NC_017857	GCA	2	6	209417	209422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126099
4020	NC_017857	CGC	2	6	209490	209495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126099
4021	NC_017857	AAT	2	6	209566	209571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126099
4022	NC_017857	TAT	2	6	209589	209594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126099
4023	NC_017857	CAC	2	6	209608	209613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126099
4024	NC_017857	ACTG	2	8	209690	209697	25 %	25 %	25 %	25 %	387126099
4025	NC_017857	TAG	2	6	209727	209732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126099
4026	NC_017857	CTTTG	2	10	209741	209750	0 %	60 %	20 %	20 %	387126099
4027	NC_017857	TCA	2	6	209828	209833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126099
4028	NC_017857	T	6	6	209838	209843	0 %	100 %	0 %	0 %	387126099
4029	NC_017857	GAT	2	6	209881	209886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126099
4030	NC_017857	CTGG	2	8	210007	210014	0 %	25 %	50 %	25 %	387126099
4031	NC_017857	GCG	2	6	210089	210094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126099
4032	NC_017857	ACA	2	6	210125	210130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126099
4033	NC_017857	TGC	2	6	210145	210150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126099
4034	NC_017857	T	6	6	210179	210184	0 %	100 %	0 %	0 %	387126099
4035	NC_017857	TGG	2	6	210242	210247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017857	TAC	2	6	210262	210267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017857	AGC	2	6	210277	210282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017857	A	7	7	210285	210291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017857	ATTT	2	8	210297	210304	25 %	75 %	0 %	0 %	387126100
4040	NC_017857	CTG	2	6	210429	210434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4041	NC_017857	CGA	2	6	210455	210460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4042	NC_017857	GGTT	2	8	210494	210501	0 %	50 %	50 %	0 %	387126100
4043	NC_017857	TGA	2	6	210541	210546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126100
4044	NC_017857	TGCT	2	8	210549	210556	0 %	50 %	25 %	25 %	387126100
4045	NC_017857	CTG	2	6	210600	210605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4046	NC_017857	CTG	2	6	210655	210660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4047	NC_017857	TGTTC	2	10	210731	210740	0 %	60 %	20 %	20 %	387126100
4048	NC_017857	TGT	2	6	210775	210780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126100
4049	NC_017857	GCA	2	6	210798	210803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4050	NC_017857	TCA	2	6	210824	210829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126100
4051	NC_017857	AAC	2	6	210830	210835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126100
4052	NC_017857	GTC	3	9	210908	210916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4053	NC_017857	CGG	2	6	210924	210929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126100
4054	NC_017857	GAT	2	6	210935	210940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126100
4055	NC_017857	TAA	2	6	211005	211010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126100
4056	NC_017857	CGC	2	6	211016	211021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126100
4057	NC_017857	GATT	2	8	211079	211086	25 %	50 %	25 %	0 %	387126100
4058	NC_017857	TTG	2	6	211090	211095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126100
4059	NC_017857	TGA	2	6	211115	211120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126100
4060	NC_017857	GTT	2	6	211176	211181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126100
4061	NC_017857	CCAG	2	8	211194	211201	25 %	0 %	25 %	50 %	387126100
4062	NC_017857	GCT	2	6	211205	211210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126100
4063	NC_017857	ATA	2	6	211259	211264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126101
4064	NC_017857	GCT	2	6	211424	211429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126101
4065	NC_017857	TTC	3	9	211455	211463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126101
4066	NC_017857	CGA	3	9	211525	211533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126101
4067	NC_017857	AATC	2	8	211538	211545	50 %	25 %	0 %	25 %	387126101
4068	NC_017857	TGTT	2	8	211602	211609	0 %	75 %	25 %	0 %	387126101
4069	NC_017857	CAAC	2	8	211672	211679	50 %	0 %	0 %	50 %	387126101
4070	NC_017857	ATG	2	6	211710	211715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126101
4071	NC_017857	CGT	2	6	211753	211758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017857	AATGAG	2	12	211774	211785	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017857	GGT	2	6	212081	212086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126102
4074	NC_017857	TCG	2	6	212118	212123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4075	NC_017857	CAT	2	6	212128	212133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126102
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4077	NC_017857	C	6	6	212298	212303	0 %	0 %	0 %	100 %	387126102
4078	NC_017857	AAT	2	6	212326	212331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126102
4079	NC_017857	GCT	2	6	212337	212342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4080	NC_017857	TAA	2	6	212549	212554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126102
4081	NC_017857	GAC	2	6	212624	212629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4082	NC_017857	TCGA	2	8	212676	212683	25 %	25 %	25 %	25 %	387126102
4083	NC_017857	GTG	2	6	212700	212705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126102
4084	NC_017857	CCA	2	6	212745	212750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126102
4085	NC_017857	AC	3	6	212794	212799	50 %	0 %	0 %	50 %	387126102
4086	NC_017857	GAA	2	6	212871	212876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126102
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4088	NC_017857	GGC	2	6	212998	213003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126102
4089	NC_017857	GTT	2	6	213041	213046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126102
4090	NC_017857	ATC	2	6	213188	213193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126102
4091	NC_017857	CCG	2	6	213250	213255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126102
4092	NC_017857	CAT	2	6	213418	213423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126102
4093	NC_017857	ATGA	2	8	213605	213612	50 %	25 %	25 %	0 %	387126102
4094	NC_017857	GCC	2	6	213647	213652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126102
4095	NC_017857	CAC	2	6	213656	213661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126102
4096	NC_017857	TGA	2	6	213779	213784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126102
4097	NC_017857	TGT	2	6	213864	213869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126102
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4099	NC_017857	CTG	2	6	213983	213988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4100	NC_017857	GCT	2	6	214024	214029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4101	NC_017857	CGCT	2	8	214042	214049	0 %	25 %	25 %	50 %	387126102
4102	NC_017857	CAG	2	6	214052	214057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4103	NC_017857	AGC	2	6	214065	214070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4104	NC_017857	GCA	2	6	214101	214106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4105	NC_017857	GCA	2	6	214194	214199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4106	NC_017857	TGC	2	6	214215	214220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126102
4107	NC_017857	ACC	2	6	214256	214261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126102
4108	NC_017857	TGCT	2	8	214285	214292	0 %	50 %	25 %	25 %	387126102
4109	NC_017857	TGT	2	6	214338	214343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126102
4110	NC_017857	T	6	6	214343	214348	0 %	100 %	0 %	0 %	387126102
4111	NC_017857	T	6	6	214363	214368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017857	TCTA	2	8	214400	214407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_017857	AATCAA	2	12	214422	214433	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4114	NC_017857	T	7	7	214450	214456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017857	GAA	2	6	214494	214499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017857	CAA	2	6	214545	214550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017857	A	6	6	214569	214574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017857	GAT	2	6	214660	214665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017857	CAG	2	6	214817	214822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126103
4120	NC_017857	TAA	2	6	214865	214870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126103
4121	NC_017857	CTG	2	6	214977	214982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126103
4122	NC_017857	T	6	6	215015	215020	0 %	100 %	0 %	0 %	387126103
4123	NC_017857	ATC	2	6	215067	215072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126103
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4125	NC_017857	GTT	2	6	215285	215290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126103
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4130	NC_017857	AG	3	6	215548	215553	50 %	0 %	50 %	0 %	387126103
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4135	NC_017857	CTGC	2	8	215773	215780	0 %	25 %	25 %	50 %	387126104
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4141	NC_017857	TCA	2	6	216236	216241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4144	NC_017857	AACG	2	8	216286	216293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4145	NC_017857	TCTT	2	8	216300	216307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4146	NC_017857	A	6	6	216581	216586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_017857	GCA	2	6	217113	217118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4209	NC_017857	CAA	2	6	219317	219322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4224	NC_017857	TGA	2	6	220303	220308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126109
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4231	NC_017857	TAA	2	6	220615	220620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126109
4232	NC_017857	TGCC	2	8	220633	220640	0 %	25 %	25 %	50 %	387126109
4233	NC_017857	A	6	6	220688	220693	100 %	0 %	0 %	0 %	387126109
4234	NC_017857	CAG	2	6	220713	220718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126109
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4236	NC_017857	CAAA	2	8	220810	220817	75 %	0 %	0 %	25 %	387126109
4237	NC_017857	GTG	2	6	220829	220834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126109
4238	NC_017857	GCG	2	6	220869	220874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126109
4239	NC_017857	ACG	2	6	220905	220910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126109
4240	NC_017857	A	7	7	220986	220992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_017857	ACC	2	6	221011	221016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4242	NC_017857	T	6	6	221019	221024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_017857	CCA	3	9	221108	221116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126110
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4245	NC_017857	CAT	2	6	221199	221204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126110
4246	NC_017857	CGT	2	6	221235	221240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126110
4247	NC_017857	CTT	2	6	221242	221247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126110
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4250	NC_017857	GTT	2	6	221530	221535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126110
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4254	NC_017857	TAAT	2	8	221726	221733	50 %	50 %	0 %	0 %	387126110
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4371	NC_017857	A	6	6	227311	227316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_017857	TC	3	6	227349	227354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4442	NC_017857	A	6	6	231171	231176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4488	NC_017857	TCT	2	6	233896	233901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_017857	TGCT	2	8	233914	233921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4490	NC_017857	CGTA	2	8	233927	233934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4491	NC_017857	TCA	2	6	234029	234034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4492	NC_017857	AGT	2	6	234043	234048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4493	NC_017857	TCAGC	2	10	234063	234072	20 %	20 %	20 %	40 %	387126122
4494	NC_017857	CAG	2	6	234094	234099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126122
4495	NC_017857	CAT	2	6	234135	234140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4496	NC_017857	TGTTTC	2	12	234206	234217	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387126122
4497	NC_017857	TCA	2	6	234266	234271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126122
4498	NC_017857	ACC	3	9	234334	234342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126122
4499	NC_017857	TGA	2	6	234351	234356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126122
4500	NC_017857	CAC	2	6	234372	234377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126122

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